В последние годы налоговое законодательство России предоставляет медицинским организациям значительные преференции по налогу на прибыль организаций (НПО). Основная цель таких мер – поддержка отрасли здравоохранения, стимулирование инвестиций в медицинскую инфраструктуру и повышение доступности медицинских услуг для населения.

Основные льготы по налогу на прибыль для медицинских организаций

• Нулевая ставка (0 %) – при соблюдении определённых условий медицинские организации могут применять ставку налога на прибыль в размере ноль процентов.
• Освобождение от налогообложения прибыли от реализации медицинской продукции – согласно п. 6 ст. 2116‑I НК РФ, прибыль, полученная от продажи собственно произведённой медицинской продукции, не облагается налогом на прибыль.
• Снижение налоговой базы за счёт учёта расходов на медицинские услуги – расходы, связанные с оплатой медицинских услуг по договорам с медицинскими организациями, могут включаться в состав расходов по налогу на прибыль, если они соответствуют требованиям НК РФ и судебной практики.

Условия применения нулевой ставки по налогу на прибыль

Для того чтобы медицинская организация могла перейти на применение ставки 0 % по налогу на прибыль, необходимо выполнить следующие требования:

1. Виды деятельности – организация должна осуществлять исключительно медицинскую деятельность, включённую в утверждённый Перечень видов медицинской деятельности (утверждён Приказом Минздрава РФ).
2. Доля доходов от медицинской деятельности – доходы, полученные от оказания медицинских услуг и выполнения научно‑исследовательских работ (НИОКР) в сфере медицины, должны составлять не менее 90 % от общего объёма доходов организации.
3. Ограничение внереализационных доходов – доля внереализационных доходов (например, доходы от сдачи в аренду имущества, процентные доходы и т.п.) не должна превышать 10 % от общего дохода.
4. Отсутствие запрещённых видов деятельности – организация не должна заниматься видами деятельности, прямо запрещёнными для применения нулевой ставки (например, торговля лекарственными препаратами без лицензии, оказание платных услуг, не связанных с медицинской деятельностью).

Если все условия выполнены, организация вправе применять нулевую ставку начиная с первого дня налогового периода, в котором выполнены требования. В противном случае налог рассчитывается по общей ставке (20 % в 2024‑2025 гг., с 2025 года – 25 % в соответствии с изменениями, внесёнными в НК РФ).

Практические аспекты учёта расходов на медицинские услуги

Вопрос о включении в расходы по налогу на прибыль затрат на оплату медицинских услуг по договорам с медицинскими организациями часто возникает у работодателей, предоставляющих своим сотрудникам корпоративное медицинское обслуживание. Судебная практика и разъяснения контролирующих органов позволяют сформулировать следующие рекомендации:

• Договор должен быть оформлен в письменной форме и содержать чёткое описание оказываемых услуг, их стоимость, сроки и порядок оплаты.
• Услуги должны относиться к медицинской деятельности, включённой в Перечень видов медицинской деятельности. Например, профилактические осмотры, лечение, диагностика, реабилитация.
• Документальное подтверждение факта оказания услуг – акты выполненных работ, счета‑фактуры, платежные порталы, выписки из банка.
• Расходы должны быть экономически обоснованными и документально подтверждёнными – сумма оплаты не должна превышать рыночную стоимость аналогичных услуг.
• Запрет на включение в расходы оплаты услуг, не связанных с медицинской деятельностью (например, стоимость питания, проживания, транспорта, если они не являются частью медицинского обслуживания).

Суд Западно‑Сибирского округа в постановлении от № Ф04-3100/2024 по делу № А2### указал, что компания не вправе была учитывать расходы на оплату медицинских услуг, если договор не предусматривал оказание исключительно медицинских услуг, а включал также вспомогательные и не медицинские услуги.

Изменения в налогообложении медицинских организаций в 2025‑2026 гг.

С 1 января 2025 года в НК РФ внесены поправки, повышающие общую ставку налога на прибыль организаций с 20 % до 25 %. Однако для медицинских организаций, соблюдающих условия нулевой ставки, это изменение не влияет – они продолжают применять ставку 0 %.

Кроме того, в 2026 году Минфин России разослал письмо, уточняющее порядок расчёта доли доходов от медицинской деятельности для организаций, совмещающих медицинскую и иную деятельность (например, фармацевтическое производство, продажу медицинского оборудования). В письме указано, что при расчёте доли доходов следует учитывать только доходы, непосредственно связанные с оказанием медицинских услуг и выполнением НИОКР в сфере медицины.

Пример расчёта права на нулевую ставку

Представим условную медицинскую организацию «Здоровье+» с následujщими показателями за 2025 год:

• Общий доход – 120 000 000 руб.
• Доход от оказания медицинских услуг – 108 000 000 руб.
• Доход от выполнения НИОКР в медицине – 6 000 000 руб.
• Внереализационный доход (аренда помещения, проценты по депозитам) – 6 000 000 руб.

Рассчитаем долю доходов от медицинской деятельности:

(108 000 000 + 6 000 000) / 120 000 000 = 114 000 000 / 120 000 000 = 0,95 = 95 %

Доля внереализационных доходов:

6 000 000 / 120 000 000 = 0,05 = 5 %

Оба условия выполнены (медицинская деятельность ≥ 90 %, внереализационные доходы ≤ 10 %). Следовательно, организация «Здоровье+» имеет право применять нулевую ставку по налогу на прибыль за 2025 год.

Рекомендации для медицинских компаний

1. Провести внутренний аудит – определить виды деятельности, доли доходов и внереализационных поступлений.
2. Оформить договоры с медицинскими организациями в соответствии с требованиями НК РФ и судебной практики.
3. Сохранять всю первичную документацию (счета, акты, платежные поручения) не менее четырёх лет.
4. Консультироваться с налоговыми специалистами при планировании реорганизации, смены видов деятельности или ввода новых видов услуг.
5. Следить за обновлениями законодательства – подписка на официальные источники (КонсультантПлюс, Гарант.Ру, официальный сайт ФНС России) позволит своевременно реагировать на изменения.

Медицинские организации в России обладают существенными налоговыми преференциями, позволяющими существенно снизить или полностью обнулить налог на прибыль при соблюдении чётких условий. Ключевыми являются: соответствие виду деятельности Перечню медицинских услуг, доля доходов от медицинской деятельности и НИОКР не менее 90 %, а также ограничение внереализационных доходов до 10 %. Правильное оформление договоров, ведение документации и регулярный мониторинг законодательных изменений помогут медицинским компаниям максимально использовать предоставленные льготы и избежать налоговых рисков.

Соблюдение данных требований не только обеспечивает налоговую оптимизацию, но и способствует повышению прозрачности финансовой деятельности, что особенно важно в условиях усиленного контроля со стороны налоговых органов и общества.